患儿检查前6-8小时禁食、禁水，保持空腹。如有发热、牙齿松动、戴矫正牙套等特殊情况需向医生说明。如果有慢性病需服药的患儿，如血液病、高血压患儿需按时服用原发病的药物，控制原发病。
活检在医学中属于病理学的一种检查方法。在胃镜检查中，发现一些可疑的消化道病变，可以通过胃镜的活检孔道，用一次性活检钳快速、准确地取得这些病变的黏膜标本，然后送至病理科，对其进行病理学检测，以鉴别病变的性质，为诊断提供病理依据。并不是所有做了内镜检查的人都必须做病理检查，镜下观察如未见异常黏膜，胃皱襞正常，无黏膜充血糜烂，也没有溃疡的形成，是可以不用取活检的。
由于胶囊内镜自身没有动力装置，也无法在肠腔内注水、吸引，因此肠道准备是否充分直接影响胶囊内镜检查的图像质量和诊断效能。
在检查前患儿不能随意饮食，一般要求进食清流质饮食或禁食，而且要注意不能进食带有明显颜色的食物，例如可乐等。检查前患儿需按照医嘱要求的剂量及时间服用清肠剂，使其多次排便，尽可能达到肠道干净。由于清肠剂的剂量较大，有的患儿可能服用比较困难或者服用后出现腹痛、恶心、呕吐等不适，但为了获得更好的检查效果应尽可能按要求完成肠道准备，呕吐后必要时予以补服。
在吞服胶囊后患儿仍需禁食，医生会通过体外监控仪器实时观察胶囊位置，如果胶囊长时间没有进入小肠可能会采取变动体位、药物干预、胃镜递送等干预措施。在胶囊进入小肠数小时后患儿需要遵医嘱饮水、进食。
在整个检查过程中患儿应注意保护佩戴的记录仪，以免发生仪器损坏、接头松脱等意外情况造成检查失败。检查后胶囊会随粪便排出，患儿每次排便后都应注意观察，由于肠道蠕动速度的不同，排出胶囊的时间不等，需要耐心等待。如果胶囊超过2周仍未排出，属于胶囊滞留，应前往消化科就诊，由医生进一步检查及处理。
胶囊内镜从口腔到结肠均可观察，无创、舒适感好，但仍有限制。首先是视野盲区，胶囊内镜随着胃肠道的蠕动进行翻转、拍摄，视角有限。其次，胶囊内镜只具备拍摄功能，一旦发现病变，无法进行组织活检及镜下治疗。如果患儿本身胃肠道有憩室等结构异常或者动力弱，还可能存在胶囊内镜嵌顿无法排出体外的风险。因此，当患儿明确有息肉、异物、或消化道出血、病变等需要镜下治疗的问题，需要选择普通内镜。
如果患儿只做了普通胃镜检查，1小时左右可以先饮水，饮水后无明显咽痛，无呛咳就可以进食少量流食。
如果是无痛胃镜，在胃镜检查结束后需要等麻醉作用彻底消失方可饮水，饮水无呛咳后才可进食。
无论普通胃镜还是无痛胃镜，如果在胃镜下取活检，可酌情根据取活检组织的多少及部位来决定是否可以正常饮食。
胃镜检查结束后，患儿应先尽量选择进食稀米汤等流质食物，如无特殊不适后再进食半流食，如米粥、面条等，取活检的患儿尽量避免生冷、辛辣、刺激的饮食。
